В январе 1936 года Ю. Вороному присваивается ученая степень кандидата медицинских наук, а осенью 1936 года он избирается по конкурсу, на правах профессора, заведующим кафедрой общей хирургии Харьковского стоматологического института и Приказом НКОЗ Украины от 31.11.1936 года переводится в г. Харьков. В Харькове Ю.Вороной продолжал свою активную врачебную деятельность. Он избирается секретарем Всесоюзного съезда хирургов (1938-1939гг.), членом правления общества хирургов города Харькова (1936-1941гг.) 1941 год… Грозные раскаты Великой Отечественной войны довольно быстро докатились до Харькова - немецко-фашистские захватчики подходили к городу.

Приказом по НКОЗ Украины № 120 от 26.09.1941 года Ю.Вороной освобождается от занимаемой должности заведующего кафедрой хирургии стоматологического института. Этим же приказом были отобраны у него эвакуационные документы. Ю.Ю.Вороной направляется в распоряжение горздравотдела Харькова по обслуживанию раненых из гражданского населения и… был оставлен на оккупированной временно территории. До 23 февраля 1942 года самостоятельно "долечивал раненых гражданского населения пока не была сожжена 12-ая больница". Затем ушел из оккупированного Харькова и с 23.02.1942 по 13.02.1943 года работал сельским врачом в селе Новая Водолага Харьковской области.

Во время рейда Красной Армии 13 февраля вступил и работал хирургом в составе медсанбата 8-ой гвардейской дивизии генерала Суржакова. После внезапного выхода из боя дивизии, оперировал раненых, вынужден был остаться с ранеными воинами и спас 70 раненых от расстрела. 26 февраля 1943 года был захвачен немцами в плен… 25 декабря 1943 года бежал из плена и 1 января 1944года вышел в расположение 273 полка Красной Армии у села Янушевичи Житомирской области.

По возвращению из плена с 25.01.1944 года работал в лечебных учреждениях города Житомира, а затем заведующим отделением Житомирской областной больницы.

30.12.45г. Ю.Ю. Вороной награжден медалью "За доблестный труд в годы Великой Отечественной войны 1941-1945гг.". 05.04.46г. - награжден медалью "За победу над Германией в Великой Отечественной войне 1941-1945гг".

В 1950 году, 6 мая Ю.Вороной переводится на должность зав. отделом экспериментальной хирургии в Институте Экспериментальной биологии и патологии им. А.А.Богомольца (г. Киев).

В 1952 году Ю.Вороному была утверждена и присвоена степень доктора медицинских наук. С 21 марта 1953 года по 1961 год он работает зав. отделом кровезаменителей Киевского института переливания крови - ныне институт гематологии и трансфузиологии МЗ Украины.

И не было покоя врачу-хирургу Вороному Ю.Ю., как в довоенных годах, в военном лихолетии 1941-1945гг., да и не было покоя в послевоенном периоде его жизни.

Умер Ю.Ю.Вороной в 1961 году от хронического коронарного заболевания. Похоронен на Байковом кладбище, невдалеке от тех, с которыми в буреломные годы революционных событий начала ХХ века мечтал о стране - Украина.
Знакомясь с публикациями в научно-популярной и медицинской литературе об истории первой пересадки почки в клинических условиях, обращает внимание то, что многие авторы вносят путаницу, как в дату так и где и в каком городе была выполнена Ю.Ю. Вороным эта операция. В работе "Болезни почек" под редакцией Мождракова и Попова (София 1980г.), указывается, что операция по пересадке трупной почки человеку была впервые произведена в СССР в 1930 г. (авторами допущена ошибка, так как в 1930 году шла речь о демонстрации врачом Вороным собаки с пересаженной почкой на правой боковой поверхности шеи). Айманбеков М.А. в "Как продлить жизнь человека" (г. Фрунзе, "Киргызстан", 1983г.) указывает: "известно, что первая в мире пересадка почки человеку была сделана в Париже русским хирургом Ю.Ю. Вороным в 1934г.". А главный нефролог Украины Пыриг Л.А. в 1989 году утверждает в книге Советы врача - "Хвороби нирок", что первая в мире пересадка почки была выполнена в Киеве профессором Ю.Ю.Вороным в 1933 году в драматических условиях, (в клинику одновременно были доставлены молодая женщина с отравлением сулемой и молодой человек с черепно-мозговой травмой, который вскоре умер). А научные сотрудники кафедры урологии Харьковской медицинской академии Лесовая А.В., Мазуренко Е.В., Гарагатый А.И. в интернет- издании от 17.10.2004 г. "Исторические аспекты первой в мире трансплантации почки человеку", ссылаясь на архивные данные и ряд научных работ, в том числе на работу Мирского М.Б. в журнале "Клиническая медицина" за 1983 год - "Первая пересадка почки в клинике", позволили себе сделать заключение: "можно сделать вывод, что первая пересадка почки в мире была сделана Ю.Вороным в г. Харькове 3 апреля 1933 года". По-видимому, научные сотрудники кафедры урологии недостаточно ознакомились с работой М.Б. Мирского, как и с личным листком учета кадров и автобиографией, которую писал лично Ю.Ю. Вороной. Ведь в этих источниках нет никаких данных, которые указывали бы, в каком городе выполнялась первая операция по пересадке трупной почки живому человеку. Позволительно ли это для научных работников?
   Не лучшим образом поступил в своей версии врач-гинеколог из г. Херсона Г. Зубрис (1997г.). Он даже указывает при каких обстоятельствах и что способствовало выполнению этой операции в Харькове: якобы "... врач Ю.Вороной из Херсона сообщил телеграммой профессору Шамову: "Освоил трансплантацию почки и просит его вызов", в ответной телеграмме Шамов; "Ожидаем в клинику двадцатого...". Врач Зубрис кратко описывает и ход операции: "Вороной стоял у окна, отдавая указания хирургам, которые вырезали трупную почку, и через некоторое время по стеклянной трубочке потекла тонкой струйкой густая, темная моча. Это было 3 апреля 1933 года".
   Наиболее подробно о первой пересадке почке человеку Ю.Ю.Вороной изложил в "Трудах Всеукраинского института неотложной хирургии и переливания крови", изданных в г. Днепропетровске в 1934 году в работе "К вопросу о блокаде ретикуло-эндотелиального аппарата у человека при некоторых формах отравления сулемой и о свободной пересадке целой почки, взятой от трупа, как метод лечения анурий при этом отравлении" из научно-опорного вечернего медицинского института в городе Херсоне Всеукраинского Института Неотложной хирургии и Переливания крови.